Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ElobP62869 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ElobP62869 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ElobP62869 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ElobP62869 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ElobP62869 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ElobP62869 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ElobP62869 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ElobP62869 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ElobP62869 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ElobP62869 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ElobP62869 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ElobP62869 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ElobP62869 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ElobP62869 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ElobP62869 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ElobP62869 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ElobP62869 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ElobP62869 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ElobP62869 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ElobP62869 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ElobP62869 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ElobP62869 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ElobP62869 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ElobP62869 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ElobP62869 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ElobP62869 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ElobP62869 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ElobP62869 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ElobP62869 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ElobP62869 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ElobP62869 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ElobP62869 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ElobP62869 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ElobP62869 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ElobP62869 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ElobP62869 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ElobP62869 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ElobP62869 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ElobP62869 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ElobP62869 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ElobP62869 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ElobP62869 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ElobP62869 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ElobP62869 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ElobP62869 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ElobP62869 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ElobP62869 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ElobP62869 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ElobP62869 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ElobP62869 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ElobP62869 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ElobP62869 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ElobP62869 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ElobP62869 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ElobP62869 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ElobP62869 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ElobP62869 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ElobP62869 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ElobP62869 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ElobP62869 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ElobP62869 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ElobP62869 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ElobP62869 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ElobP62869 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ElobP62869 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ElobP62869 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ElobP62869 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ElobP62869 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ElobP62869 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ElobP62869 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ElobP62869 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ElobP62869 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ElobP62869 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ElobP62869 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ElobP62869 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ElobP62869 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ElobP62869 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ElobP62869 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ElobP62869 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ElobP62869 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ElobP62869 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ElobP62869 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ElobP62869 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ElobP62869 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ElobP62869 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ElobP62869 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ElobP62869 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ElobP62869 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ElobP62869 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElobP62869 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElobP62869 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElobP62869 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElobP62869 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElobP62869 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ElobP62869 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElobP62869 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElobP62869 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElobP62869 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElobP62869 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms