Protein–RNA interactions for Protein: P62492

Rab11a, Ras-related protein Rab-11A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11aP62492 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11aP62492 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11aP62492 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11aP62492 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11aP62492 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11aP62492 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11aP62492 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11aP62492 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11aP62492 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11aP62492 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11aP62492 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11aP62492 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11aP62492 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11aP62492 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11aP62492 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11aP62492 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11aP62492 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11aP62492 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11aP62492 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11aP62492 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms