Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpeP62305 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms