Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp46P62069 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp46P62069 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Usp46P62069 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Usp46P62069 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Usp46P62069 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Usp46P62069 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Usp46P62069 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Usp46P62069 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Usp46P62069 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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Usp46P62069 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Usp46P62069 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Usp46P62069 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp46P62069 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp46P62069 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp46P62069 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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