Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrch1P62046 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrch1P62046 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms