Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vbp1P61759 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms