Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf13P61216 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf13P61216 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf13P61216 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf13P61216 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf13P61216 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Taf13P61216 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf13P61216 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf13P61216 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms