Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chp1P61022 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chp1P61022 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chp1P61022 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Chp1P61022 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chp1P61022 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chp1P61022 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chp1P61022 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chp1P61022 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chp1P61022 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chp1P61022 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chp1P61022 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chp1P61022 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chp1P61022 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chp1P61022 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chp1P61022 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chp1P61022 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chp1P61022 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chp1P61022 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chp1P61022 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chp1P61022 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chp1P61022 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chp1P61022 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chp1P61022 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms