Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms