Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b6P59708 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms