Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup43P59235 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup43P59235 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup43P59235 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup43P59235 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup43P59235 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup43P59235 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup43P59235 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup43P59235 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup43P59235 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms