Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps33bP59016 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps33bP59016 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms