Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tpm2P58774 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms