Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Dpf3P58269 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dpf3P58269 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Dpf3P58269 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dpf3P58269 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dpf3P58269 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dpf3P58269 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dpf3P58269 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dpf3P58269 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dpf3P58269 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dpf3P58269 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf3P58269 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf3P58269 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf3P58269 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf3P58269 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf3P58269 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Dpf3P58269 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf3P58269 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf3P58269 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf3P58269 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf3P58269 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf3P58269 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf3P58269 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf3P58269 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf3P58269 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf3P58269 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf3P58269 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf3P58269 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf3P58269 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dpf3P58269 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf3P58269 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf3P58269 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf3P58269 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dpf3P58269 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dpf3P58269 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dpf3P58269 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dpf3P58269 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dpf3P58269 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dpf3P58269 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dpf3P58269 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dpf3P58269 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dpf3P58269 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Dpf3P58269 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dpf3P58269 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Dpf3P58269 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dpf3P58269 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dpf3P58269 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dpf3P58269 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dpf3P58269 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms