Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TdgP56581 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TdgP56581 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TdgP56581 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TdgP56581 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TdgP56581 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TdgP56581 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TdgP56581 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TdgP56581 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TdgP56581 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TdgP56581 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TdgP56581 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TdgP56581 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TdgP56581 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TdgP56581 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TdgP56581 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TdgP56581 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TdgP56581 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TdgP56581 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TdgP56581 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TdgP56581 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TdgP56581 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdgP56581 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdgP56581 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdgP56581 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdgP56581 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdgP56581 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdgP56581 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdgP56581 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdgP56581 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdgP56581 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdgP56581 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdgP56581 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdgP56581 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdgP56581 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdgP56581 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdgP56581 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdgP56581 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TdgP56581 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TdgP56581 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TdgP56581 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TdgP56581 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TdgP56581 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TdgP56581 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TdgP56581 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TdgP56581 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TdgP56581 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TdgP56581 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TdgP56581 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TdgP56581 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TdgP56581 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TdgP56581 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TdgP56581 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TdgP56581 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TdgP56581 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TdgP56581 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TdgP56581 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TdgP56581 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TdgP56581 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TdgP56581 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TdgP56581 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TdgP56581 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TdgP56581 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TdgP56581 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TdgP56581 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TdgP56581 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TdgP56581 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TdgP56581 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TdgP56581 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TdgP56581 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TdgP56581 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TdgP56581 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TdgP56581 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TdgP56581 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TdgP56581 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TdgP56581 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TdgP56581 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TdgP56581 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TdgP56581 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TdgP56581 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TdgP56581 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TdgP56581 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TdgP56581 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TdgP56581 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TdgP56581 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TdgP56581 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TdgP56581 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TdgP56581 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TdgP56581 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TdgP56581 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TdgP56581 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TdgP56581 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TdgP56581 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TdgP56581 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TdgP56581 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TdgP56581 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TdgP56581 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TdgP56581 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TdgP56581 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TdgP56581 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms