Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms