Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CckbrP56481 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CckbrP56481 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CckbrP56481 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CckbrP56481 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CckbrP56481 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckbrP56481 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckbrP56481 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms