Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp5bP56480 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp5bP56480 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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