Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp1P55194 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms