Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Faf1P54731 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Faf1P54731 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Faf1P54731 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Faf1P54731 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Faf1P54731 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Faf1P54731 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Faf1P54731 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Faf1P54731 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Faf1P54731 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Faf1P54731 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Faf1P54731 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Faf1P54731 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Faf1P54731 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Faf1P54731 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Faf1P54731 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Faf1P54731 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Faf1P54731 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Faf1P54731 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms