Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacnb3P54285 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacnb3P54285 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms