Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efnb1P52795 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efnb1P52795 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms