Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClgnP52194 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ClgnP52194 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ClgnP52194 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClgnP52194 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ClgnP52194 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ClgnP52194 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClgnP52194 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClgnP52194 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms