Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FanccP50652 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FanccP50652 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FanccP50652 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FanccP50652 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FanccP50652 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FanccP50652 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FanccP50652 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FanccP50652 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FanccP50652 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FanccP50652 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FanccP50652 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FanccP50652 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FanccP50652 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FanccP50652 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FanccP50652 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FanccP50652 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FanccP50652 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FanccP50652 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FanccP50652 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FanccP50652 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FanccP50652 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FanccP50652 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FanccP50652 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FanccP50652 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FanccP50652 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FanccP50652 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FanccP50652 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FanccP50652 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FanccP50652 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FanccP50652 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FanccP50652 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FanccP50652 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FanccP50652 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FanccP50652 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FanccP50652 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FanccP50652 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FanccP50652 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FanccP50652 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FanccP50652 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FanccP50652 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FanccP50652 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FanccP50652 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FanccP50652 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FanccP50652 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FanccP50652 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FanccP50652 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FanccP50652 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FanccP50652 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FanccP50652 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FanccP50652 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FanccP50652 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FanccP50652 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FanccP50652 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FanccP50652 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FanccP50652 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FanccP50652 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FanccP50652 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FanccP50652 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FanccP50652 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FanccP50652 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FanccP50652 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FanccP50652 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FanccP50652 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FanccP50652 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FanccP50652 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FanccP50652 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FanccP50652 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FanccP50652 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FanccP50652 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FanccP50652 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FanccP50652 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FanccP50652 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FanccP50652 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FanccP50652 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FanccP50652 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FanccP50652 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FanccP50652 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FanccP50652 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FanccP50652 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FanccP50652 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FanccP50652 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FanccP50652 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FanccP50652 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FanccP50652 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FanccP50652 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FanccP50652 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FanccP50652 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FanccP50652 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FanccP50652 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FanccP50652 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FanccP50652 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FanccP50652 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FanccP50652 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FanccP50652 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FanccP50652 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FanccP50652 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FanccP50652 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FanccP50652 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FanccP50652 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms