Protein–RNA interactions for Protein: P50538

Mxd1, Max dimerization protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mxd1P50538 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mxd1P50538 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mxd1P50538 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mxd1P50538 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mxd1P50538 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mxd1P50538 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mxd1P50538 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mxd1P50538 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Mxd1P50538 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mxd1P50538 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mxd1P50538 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mxd1P50538 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mxd1P50538 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mxd1P50538 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mxd1P50538 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mxd1P50538 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mxd1P50538 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mxd1P50538 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mxd1P50538 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mxd1P50538 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mxd1P50538 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mxd1P50538 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mxd1P50538 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mxd1P50538 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mxd1P50538 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mxd1P50538 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mxd1P50538 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mxd1P50538 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mxd1P50538 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Mxd1P50538 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mxd1P50538 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mxd1P50538 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mxd1P50538 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mxd1P50538 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mxd1P50538 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mxd1P50538 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mxd1P50538 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mxd1P50538 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mxd1P50538 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mxd1P50538 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mxd1P50538 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mxd1P50538 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mxd1P50538 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mxd1P50538 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Mxd1P50538 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms