Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtshP49935 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtshP49935 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtshP49935 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtshP49935 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtshP49935 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtshP49935 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CtshP49935 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtshP49935 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtshP49935 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtshP49935 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtshP49935 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtshP49935 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtshP49935 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtshP49935 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtshP49935 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtshP49935 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtshP49935 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtshP49935 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtshP49935 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtshP49935 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtshP49935 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtshP49935 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtshP49935 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CtshP49935 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CtshP49935 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtshP49935 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtshP49935 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtshP49935 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtshP49935 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtshP49935 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtshP49935 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtshP49935 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtshP49935 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtshP49935 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtshP49935 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtshP49935 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtshP49935 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtshP49935 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtshP49935 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtshP49935 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtshP49935 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtshP49935 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CtshP49935 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtshP49935 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CtshP49935 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtshP49935 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtshP49935 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtshP49935 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtshP49935 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CtshP49935 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtshP49935 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtshP49935 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtshP49935 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtshP49935 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtshP49935 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtshP49935 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtshP49935 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtshP49935 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtshP49935 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CtshP49935 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CtshP49935 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CtshP49935 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtshP49935 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtshP49935 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtshP49935 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtshP49935 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CtshP49935 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtshP49935 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtshP49935 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtshP49935 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtshP49935 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtshP49935 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtshP49935 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtshP49935 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtshP49935 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtshP49935 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtshP49935 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CtshP49935 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtshP49935 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtshP49935 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtshP49935 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtshP49935 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtshP49935 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtshP49935 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtshP49935 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtshP49935 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtshP49935 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtshP49935 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtshP49935 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CtshP49935 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtshP49935 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtshP49935 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtshP49935 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtshP49935 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtshP49935 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtshP49935 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtshP49935 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CtshP49935 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtshP49935 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms