Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5P49615 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms