Protein–RNA interactions for Protein: P49582

Chrna7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna7P49582 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna7P49582 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms