Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brca1P48754 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brca1P48754 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brca1P48754 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brca1P48754 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Brca1P48754 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Brca1P48754 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brca1P48754 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brca1P48754 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brca1P48754 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brca1P48754 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brca1P48754 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brca1P48754 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brca1P48754 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms