Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rfx1P48377 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfx1P48377 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms