Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms