Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbx2P48031 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms