Protein–RNA interactions for Protein: P47880

Igfbp6, Insulin-like growth factor-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp6P47880 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Igfbp6P47880 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Igfbp6P47880 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Igfbp6P47880 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Igfbp6P47880 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Igfbp6P47880 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms