Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elk1P41969 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elk1P41969 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elk1P41969 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elk1P41969 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Elk1P41969 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Elk1P41969 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Elk1P41969 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Elk1P41969 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms