Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pbx1P41778 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pbx1P41778 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pbx1P41778 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pbx1P41778 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Pbx1P41778 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pbx1P41778 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pbx1P41778 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pbx1P41778 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pbx1P41778 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pbx1P41778 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pbx1P41778 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pbx1P41778 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pbx1P41778 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pbx1P41778 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pbx1P41778 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pbx1P41778 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pbx1P41778 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pbx1P41778 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pbx1P41778 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pbx1P41778 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pbx1P41778 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pbx1P41778 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pbx1P41778 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pbx1P41778 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pbx1P41778 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pbx1P41778 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pbx1P41778 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pbx1P41778 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pbx1P41778 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pbx1P41778 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pbx1P41778 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pbx1P41778 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pbx1P41778 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Pbx1P41778 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Pbx1P41778 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pbx1P41778 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pbx1P41778 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pbx1P41778 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pbx1P41778 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pbx1P41778 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pbx1P41778 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pbx1P41778 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pbx1P41778 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pbx1P41778 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pbx1P41778 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pbx1P41778 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms