Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt4P40749 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt4P40749 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt4P40749 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt4P40749 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syt4P40749 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syt4P40749 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syt4P40749 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syt4P40749 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms