Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Chd1P40201 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Chd1P40201 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Chd1P40201 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Chd1P40201 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Chd1P40201 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Chd1P40201 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Chd1P40201 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Chd1P40201 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Chd1P40201 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Chd1P40201 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms