Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cap1P40124 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cap1P40124 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cap1P40124 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cap1P40124 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cap1P40124 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cap1P40124 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cap1P40124 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cap1P40124 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cap1P40124 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cap1P40124 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cap1P40124 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cap1P40124 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cap1P40124 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cap1P40124 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cap1P40124 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cap1P40124 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cap1P40124 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 209.4 ms