Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf1P39428 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf1P39428 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf1P39428 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf1P39428 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf1P39428 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf1P39428 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf1P39428 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Traf1P39428 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf1P39428 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf1P39428 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf1P39428 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf1P39428 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf1P39428 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf1P39428 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf1P39428 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf1P39428 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf1P39428 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf1P39428 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf1P39428 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf1P39428 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf1P39428 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms