Protein–RNA interactions for Protein: P38532

Hsf1, Heat shock factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf1P38532 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hsf1P38532 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hsf1P38532 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hsf1P38532 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hsf1P38532 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hsf1P38532 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hsf1P38532 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hsf1P38532 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hsf1P38532 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hsf1P38532 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hsf1P38532 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hsf1P38532 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hsf1P38532 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hsf1P38532 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hsf1P38532 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hsf1P38532 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hsf1P38532 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hsf1P38532 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hsf1P38532 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hsf1P38532 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hsf1P38532 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hsf1P38532 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hsf1P38532 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hsf1P38532 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hsf1P38532 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hsf1P38532 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hsf1P38532 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hsf1P38532 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms