Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ddit3P35639 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms