Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TpoP35419 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TpoP35419 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TpoP35419 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TpoP35419 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TpoP35419 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TpoP35419 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TpoP35419 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TpoP35419 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TpoP35419 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TpoP35419 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TpoP35419 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TpoP35419 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TpoP35419 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TpoP35419 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TpoP35419 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TpoP35419 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TpoP35419 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TpoP35419 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TpoP35419 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TpoP35419 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TpoP35419 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TpoP35419 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TpoP35419 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TpoP35419 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TpoP35419 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TpoP35419 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TpoP35419 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TpoP35419 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TpoP35419 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TpoP35419 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TpoP35419 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TpoP35419 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TpoP35419 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TpoP35419 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TpoP35419 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TpoP35419 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TpoP35419 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TpoP35419 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TpoP35419 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TpoP35419 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TpoP35419 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TpoP35419 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TpoP35419 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TpoP35419 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TpoP35419 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TpoP35419 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TpoP35419 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TpoP35419 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TpoP35419 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TpoP35419 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TpoP35419 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TpoP35419 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TpoP35419 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TpoP35419 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TpoP35419 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TpoP35419 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TpoP35419 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TpoP35419 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TpoP35419 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TpoP35419 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TpoP35419 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TpoP35419 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TpoP35419 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TpoP35419 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TpoP35419 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TpoP35419 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TpoP35419 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TpoP35419 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpoP35419 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpoP35419 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpoP35419 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpoP35419 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpoP35419 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpoP35419 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpoP35419 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpoP35419 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpoP35419 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpoP35419 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpoP35419 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpoP35419 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpoP35419 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpoP35419 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpoP35419 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpoP35419 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TpoP35419 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpoP35419 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpoP35419 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpoP35419 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpoP35419 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpoP35419 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpoP35419 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpoP35419 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpoP35419 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpoP35419 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpoP35419 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpoP35419 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TpoP35419 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TpoP35419 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpoP35419 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 511.4 ms