Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab5cP35278 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms