Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptpn11P35235 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptpn11P35235 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptpn11P35235 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ptpn11P35235 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn11P35235 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms