Protein–RNA interactions for Protein: P32883

Kras, GTPase KRas, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KrasP32883 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KrasP32883 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KrasP32883 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KrasP32883 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KrasP32883 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KrasP32883 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KrasP32883 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KrasP32883 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KrasP32883 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KrasP32883 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KrasP32883 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KrasP32883 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KrasP32883 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KrasP32883 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KrasP32883 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KrasP32883 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KrasP32883 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KrasP32883 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KrasP32883 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KrasP32883 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KrasP32883 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KrasP32883 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KrasP32883 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KrasP32883 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KrasP32883 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KrasP32883 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KrasP32883 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KrasP32883 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KrasP32883 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KrasP32883 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KrasP32883 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KrasP32883 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KrasP32883 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KrasP32883 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KrasP32883 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KrasP32883 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KrasP32883 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KrasP32883 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KrasP32883 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KrasP32883 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KrasP32883 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KrasP32883 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KrasP32883 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KrasP32883 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KrasP32883 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KrasP32883 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KrasP32883 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KrasP32883 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KrasP32883 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KrasP32883 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
KrasP32883 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KrasP32883 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KrasP32883 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KrasP32883 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KrasP32883 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KrasP32883 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KrasP32883 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KrasP32883 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KrasP32883 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KrasP32883 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KrasP32883 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KrasP32883 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KrasP32883 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KrasP32883 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KrasP32883 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KrasP32883 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KrasP32883 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KrasP32883 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KrasP32883 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KrasP32883 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KrasP32883 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KrasP32883 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KrasP32883 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KrasP32883 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KrasP32883 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KrasP32883 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KrasP32883 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KrasP32883 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KrasP32883 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KrasP32883 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KrasP32883 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KrasP32883 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KrasP32883 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KrasP32883 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KrasP32883 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KrasP32883 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KrasP32883 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KrasP32883 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KrasP32883 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KrasP32883 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KrasP32883 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KrasP32883 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KrasP32883 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KrasP32883 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KrasP32883 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KrasP32883 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KrasP32883 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KrasP32883 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KrasP32883 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KrasP32883 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms