Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gsx2P31316 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms