Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc11P31313 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms