Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk4P30285 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk4P30285 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms