Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pabpc1P29341 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms