Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkcdP28867 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcdP28867 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms